Innehållsförteckning:

Hur räknar man ut GC?
Hur räknar man ut GC?

Video: Hur räknar man ut GC?

Video: Hur räknar man ut GC?
Video: Area 2024, November
Anonim

Vad är GC Innehåll? GC innehållet är vanligtvis beräknad som ett procentvärde och ibland kallat G+C-förhållande eller GC -förhållande. GC -innehållsprocenten är beräknad som Count(G + C)/Count(A + T + G + C) * 100%.

Att veta är också, hur hittar man GC-innehållet i en sekvens?

Steg

  1. Spåra genom sekvensen och räkna antalet cytosin (C) eller guanin (G) nukleotider.
  2. Dela antalet cytosin- och guaninukleotider med det totala antalet baspar i sekvensen.

Dessutom, vad är ett högt GC-innehåll? Tack för ditt tydliga svar! Det är min uppfattning att när jag använder GC-innehåll som ett sätt att klassificera en bakterie i antingen Firmicute eller Actinobacteria phylum 60% är cutoff. Över 60 % anses vara hög GC och därför Actinobacteria, och under 60% anses vara låg, och därför Firmicute.

hur räknar man ut svarsfaktor i GC?

Generalen formel för en svarsfaktor för GC är topparea dividerat med dess koncentration för en kemisk komponent. I vissa fall används toppens höjd istället för arean. Släktingen svarsfaktor (RRF) är alltså en svarsfaktor delad med en annan.

Vad betyder GC-innehåll?

Inom molekylärbiologi och genetik, GC - innehåll (eller guanin-cytosin innehåll ) är procentandelen kvävehaltiga baser i en DNA- eller RNA-molekyl som är antingen guanin (G) eller cytosin (C).

Rekommenderad: