Innehållsförteckning:

Varför är det nödvändigt att rena PCR-produkter före sekvensering?
Varför är det nödvändigt att rena PCR-produkter före sekvensering?

Video: Varför är det nödvändigt att rena PCR-produkter före sekvensering?

Video: Varför är det nödvändigt att rena PCR-produkter före sekvensering?
Video: DNA Sequencing and PCR | Biology 2024, November
Anonim

Verifiering av önskad produkt är grundläggande , vilket inkluderar att bekräfta en brist på ospecifika Produkter och primerdimerer. Rena -upp av reaktionsblandningen är också nödvändig för att ta bort oinkorporerade primrar och dNTP som kan störa efterföljande reaktioner och leda till en oläsbar sekvens.

Dessutom, varför är det nödvändigt att rena PCR-produkter?

Du behöver rena PCR-produkter för att bli av med oanvända primrar, nukleotider och enzymer för att optimera framgången med ligering, vilket kommer att upprätthålla och sekvensera produkt av PCR . Till rena de PCR-produkter storleksexklusionskromatografi används.

Man kan också fråga sig, bör man rena PCR-produkter innan restriktionsendonukleas-digestion? Majoriteten av restriktion enzymer är aktiva i PCR buffertar. För kloningsapplikationer, rening av PCR-produkter före matsmältning är nödvändig för att avlägsna det aktiva termofila DNA-polymeraset som finns i PCR blandning. DNA-polymeraser kan förändra ändarna av det klyvda DNA:t och minska utbytet av ligering.

Folk frågar också, hur förbereder man PCR-produkter för sekvensering?

Direkt sekvensering av PCR-produkter

  1. Se till att du amplifierat rätt fragment.
  2. Du måste ta bort alla kvarvarande PCR-primrar och oinkorporerade nukleotider.
  3. Om PCR-primrarna också kommer att vara sekvenseringsprimer(arna), se till att de matchar våra villkor.
  4. Överkoncentrera inte provet!

Kan du sekvensera PCR-produkt?

Direkt Sekvensering av PCR-produkter . Sekvensering endast använder ett primer istället för de två som används i PCR . Om du gör inte ta bort båda primers, du kommer få två sekvenser överlagrade på varandra som inte är läsbara. Det är OK att använda en PCR primer för sekvensering så länge det matchar våra förutsättningar.

Rekommenderad: